参考答案：B

解析：

B。解析：淀粉酶的底物是淀粉，将淀粉链水解为不同长度的多聚葡萄糖。淀粉是糖类，不含肽键，肽酶断开的是肽键，A错误。ATP水解酶通常作用于远离A的那个高能磷酸键，使ATP水解为ADP和Pi，B正确。限制性核酸内切酶是可以识别DNA的特异序列，并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶，简称限制酶。限制酶断开的是DNA链中的磷酸二酯键，C错误。解旋酶作用于氢键，使碱基间的氢键断裂，从而使双链DNA分子解旋为单链.D错误。