参考答案：D

解析：[考点] 本题考查的知识点为行政复议的管辖。
《行政复议法》第15条规定，对两个或两个以上行政机关以共同的名义作出的具体行政行为不服的，向他们共同的上一级行政机关申请复议。行政机关甲和行政机关乙对企业的行政处罚是以共同名义作出的，那么对该企业申请的复议应由甲和乙的共同的上一级机关管辖。