参考答案：A

解析：《民诉意见》第45条规定：“个体工商户、农村承包经营户、合伙组织雇佣的人员在进行雇佣合同规定的生产经营活动中造成他人损害的，其雇主是当事人。”本案中，吴某某是该合伙企业的雇员并在从事雇佣合同规定的运输过程中给王某造成了损害，因此其雇主该合伙企业为被告。在这里还要注意的一个问题是，根据《民诉意见》第40条第1项，合伙企业虽然不具备法人资格，但是可以作为民事诉讼的当事人。因此，A项当选。