参考答案：D

解析：申请工程咨询企业名称预先登记需提交的文件、证件有：企业名称预先登记申请书，组建单位的资格证明或股东、发起人的法人资格证明及自然人身份证明；指定(委托)书；公司章程；具有法定资格的验资机构出具的验资证明；股东的法人资格证明或自然人身份证明；公司法定代表人任职文件和身份证明；公司名称预先核准通知书；公司住所证明。