参考答案：C

解析： 本题考查重点是对“现金与银行存款审计——函证”的掌握。为了达到函证目的，函证时，审计人员应向被审计单位在本年存过款的所有银行发函，其中包括存款账户已结清的银行。所以选项A不正确。对于审计人员已直接从某一银行获得了银行对账单和所有已付支票的，仍应向这一银行进行函证。所以选项B不正确。由于审计人员决定对银行存款余额实施肯定式函证，所以当在规定时间未回复时，应再寄出第二次询证函。所以选项D不正确。因此，本题的正确答案为C。