参考答案：D

解析： 《刑事诉讼法司法解释》第33条规定。人民法院审判案件过程中，应当充分保证被告人行使刑事诉讼法第三十二条规定的辩护权利。但下列人员不得被委托担任辩护人：(一)被宣告缓刑和刑罚尚未执行完毕的人；(二)依法被剥夺、限制人身自由的人；(三)无行为能力或者限制行为能力的人；(四)人民法院、人民检察院、公安机关、国家安全机关、监狱的现职人员；(五)本院的人民陪审员；(六)与本案审理结果有利害关系的人；(七)外国人或者无国籍人。前款第(四)、(五)、(六)、(七)项规定的人员，如果是被告人的近亲属或者监护人，由被告人委托担任辩护人的，人民法院可以准许。
A项刑事诉讼中的“近亲属”是指夫、妻、父、母、子、女、同胞兄弟姊妹。故林某的爷爷不是林某的近亲属，不能被委托担任辩护人，A项错误。B项林某16岁的儿子属于限制行为能力人，依法不能担任辩护人，B项错误。C项甲属于与本案审理结果有利害关系的人，不能担任辩护人。C项错误。D项乙是司法行政部门负责人，不属于人民法院、人民检察院、公安机关、国家安全机关、监狱的现职人员，可以担任辩护人，D项正确。故本题正确选项为D。