参考答案：D

解析： 本题考查的知识点是伪证罪和帮助当事人毁灭证据罪。《刑法》第305条规定，在刑事诉讼中，证人、鉴定人、记录人、翻译人对与案件有重要关系的情节，故意作虚假证明、鉴定、记录、翻译，意图陷害他人或者隐匿罪证的，处3年以下有期徒刑或者拘役；情节严重的，处3年以上 7年以下有期徒刑。
《刑法》第307条规定，……帮助当事人毁灭、伪造证据，情节严重的，处3年以下有期徒刑或者拘役。张甲作为案件的证人，对与案件有重要关系的情节作了虚假的证明，符合了伪证罪的构成要件，因此构成伪证罪。同时张甲还帮助张乙一起毁灭了作案工具铁榔头一把，是帮助当事人毁灭证据的行为，构成帮助毁灭证据罪。因此应当对张甲以伪证罪和帮助毁灭证据罪定罪，实行数罪并罚。正确答案为D。