A、银杏是裸子植物，小麦大熊猫是被子植物，它们同属于种子植物门，即同门．

B、鲸和人同属于哺乳纲．即同纲．

C、猫和虎同属于猫科．即同科．

D、苔藓和蕨同属于孢子植物门．即同门．

由分析可知界门、纲、科中科是最小的，猫和虎同属于猫科．因此它们的亲缘关系最近，可见C符合题意．

故选：C．