A、体温计中的水银（汞）热胀冷缩是因为汞原子之间的间隔随着温度的升高而增大，随着温度的降低而减小，而不是改变原子的体积大小；故选项解释错误．

B、一滴水中含有很多的水分子，说明水分子很小，故选项解释正确．

C、敞口容器内的酒精逐渐减少，是由于酒精分子不断的运动到空气中的缘故，故选项解释正确．

D、一氧化碳和二氧化碳化学性质不同是因为构成这两种物质的分子的结构不同，故选项解释正确．

故选A．