参考答案：C

解析： 三国时，孙权派人到夷州(台湾)，加强夷州与内地的联系；隋朝时，隋炀帝三次派人到流求(台湾)。但是真正在台湾设立管辖机构的是元朝，元朝时设立澎湖巡检司，负责管辖澎湖和流求。