参考答案：C,D

解析： 根据《建设工程监理规范》5.4.12条，施工存在重大质量隐患，应通过总监理工程师及时下达工程暂停令，要求承包单位停工整改，选项A不符合题意；根据6.1.2条，承包单位拒绝项目监理机构的管理、施工中出现重大安全隐患时应由总监理工程师签发工程暂停令，选项B、E不符合题意；根据5.6.3条，选项D符合题意；根据5.4.6条，选项C符合题意。注意专业监理工程师签发监理工程师通知单，总监理工程师签发工程暂停令的情况是有区别的。