A、空气能被压缩，是由于分子间有间隔，气体受压后，分子间的间隔变小，而不是分子体积变小，故选项解释错误．

B、甘蔗甜，苦瓜苦，是由于构成甘蔗、苦瓜不同分子性质不同，故选项解释正确．

C、分子总是在不断的运动的，结冰的水不能流动，是由于水分子运动的速度变慢了，而不是不再运动，故选项解释错误．

D、50mL水和50mL酒精混合后的总体积小于100mL，是因为分子之间有间隔，一部分水分子和酒精分子会互相占据分子之间的间隔，故选项解释错误．

故选B．