参考答案：

(1)生物学功能：①作为诱导同种异体移植排斥反应的靶抗原；②参与免疫应答的调控(MHC限制性、抗原转递、补体产生等)；③某些HLA的表达与疾病发生的关系。

(2)临床关系：①研究某些疾病的遗传倾向(某些特定的HLA表达与疾病，HLA表达异常与疾病的关系)；②器官移植时选择供体和预测排斥反应；③亲子鉴定等法医学应用。