参考答案：B

解析： 根据《刑事诉讼法》第十五条第二项的规定，犯罪已过追诉时效期限的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪。这几种处理方式，分别对应不同的程序。在本题中，案件处于侦查阶段，应撤销案件。故选B。