参考答案：B

解析： 查阅被审计单位的内部控制手册，只能表明被审计单位设计了该项控制，但不能证明其已经有效运行，所以选项A不正确；检查执行该程序的文件记录和对该项控制采用穿行测试，正是由于该项控制的运行没有交易轨迹，故这两个程序难以执行，所以选项CD不正确。