教室喷洒过氧乙酸溶液后，教室内充满过氧乙酸味，是因为过氧乙酸中含有的分子是在不断的运动的，向四周扩散，使教室内充满过氧乙酸味．

A、由分子的性质可知，教室内充满过氧乙酸味的主要原因与分子可分无关，故选项错误．

B、由于分子是在不断的运动的，这是造成教室内充满过氧乙酸味的主要原因，故选项正确．

C、由分子的性质可知，教室内充满过氧乙酸味的主要原因与分子的大小无关，故选项错误．

D、由分子的性质可知，教室内充满过氧乙酸味的主要原因与分子之间有间隔无关，故选项错误．

故选B．