A、墙内开花墙外香，是因为花香中含有的分子是在不断运动的，向四周扩散，使人们闻到花香，故选项解释正确．

B、用水银温度计测量体温，是因为温度升高，汞原子间间隙变大（而不是原子变大），故选项解释错误．

C、金刚石和石墨物理性质差异大，是因为碳原子的排列方式不同，故选项解释错误．

D、决定元素化学性质的最外层电子数，钠原子和钠离子化学性质不同，是因为钠原子和钠离子最外层电子数不同．

故答案为：A；最外层电子数．