A、氯化钠是由钠离子和氯离子构成的，故选项错误．

B、苯是由苯分子构成的，故选项正确．

C、金刚石属于固态非金属单质，是由碳原子直接构成的，故选项错误．

D、纳米铜属于金属单质，是由铜原子直接构成的，故选项错误．

故选：B．