参考答案：D

解析：[考点] 立案管辖；公安机关、人民检察院直接受理的案件 [详解] 根据《刑事诉讼法》第18条第2款规定，选项A中林业局副局长王某违法发放林木采伐许可证案属于国家工作人员的渎职犯罪，选项B中昊某破坏选举案属于侵犯公民民主权利的犯罪，选项C中李某利用职务阻碍解救被拐卖儿童属于国家工作人员的渎职犯罪，依法均应当由人民检察院立案侦查。选项D中钟某涉嫌传染病菌种扩散罪，该罪不属于前条规定的人民检察院立案侦查的范围，应当由公安机关直接受理立案侦查。因此正确答案是D。