参考答案：C

解析：在清末变法修律过程中，为配合官制改革及一些新的诉讼法规的颁行，清政府也对相传已久的旧体制和审判制度进行了一些改革。清末改大理寺为大理院，作为全国最高审判机关。选项A、B不正确，南京国民政府时期，普通法院分地方法院、高等法院、最高法院三级。选项D不正确，清末自1906年开始，改刑部为法部，掌管全国司法行政事务，以使行政与司法分立，并改按察使司为提法使司，负责地方司法行政工作及司法监督。