参考答案：C

解析：[分析]
本题考查软件著作权的归属问题。
著作权法在认定著作权人时，是根据创作的事实进行的，而创作就是指直接产生文学、艺术和科学作品的智力活动。而为他人创作进行组织、提供咨询意见、物质条件或者进行其他辅助工作的，不属于创作的范围，不被确认为著作权人。程序员甲只为软件编写了使用说明书，并没有直接参与软件开发，因此不享有应用软件的著作权。