参考答案：A,B,D

解析：根据与贸易有关的知识产权协议的规定，对于计算机程序，无论是源代码还是目标代码，应作为文学作品保护。对于商标，各成员可决定商标许可与转让的条件，但不允许商标的强制许可。对于专利，成员方应对植物品种提供保护，无论是以专利形式，还是以一种特殊有效的体系，或是以综合形式保护均可。在知识产权的实施方面，成员方的司法当局有权命令一成员方停止对知识产权的侵权行为，特别是应禁止那些对知识产权构成侵权行为的进口商品进入商业渠道。