参考答案：

结果显著性判断：查看E值列表；查看比对情况。

（1.E值是不是显著；

2.两个蛋白质是不是具有近似的大小；

3.两个蛋白质是否有共同的模体或信号序列；

4.两个蛋白质是不是一个合理的多序列比对的一部分；

5.两个蛋白质是否有一个相似的生物学功能；

6.两个蛋白质是否具有相似的3维结构。

7.如果一个BLAST搜索得到一个对另一个蛋白质的边缘匹配，以这个具有较远亲缘关系的蛋白质作为查询项再进行一次新的BLAST搜索。）