参考答案：

（1）性质不同：绝大多数国家或地区的GMP具有法律效力，而ISO9000则是推荐性的技术标准。但随着竞争的不断加剧ISO9000也可能演变成强制性标准。

（2）适用范围不同：ISO9000标准适用于各行各业。而GMP只适用于药品生产企业。