参考答案：

(1) 以DNA—DNA杂交为基础的遗传区标记，主要包括限制性片段长度多变性（restricted fragment length polymorphism, RFLP）和DNA指纹（DNA fingerprint）;

(2) 以PCR方法为基础的遗传标记，主要包括随机扩增多态性DNA（random amplified polymorphic DNA, RAPD）和微卫星DNA标记（microsatellite DNA）.

(3) 单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）.近年来，人们对分子遗传标记在犬的群体遗传学研究、基因定位及育种等方面的应用进行了广泛的研究。