参考答案：

（1）利用DNA指纹与近交系数的相关性进行个体识别与血缘关系的鉴定，作为畜禽品种的特征证明。

（2）利用DNA指纹与遗传距离的相关性，进行种群内遗传纯度和彼此间遗传距离的测算，从而进行群体聚类分析和系间杂交优势的预测。