某大型工程项目由政府投资建设，业主委托某招标代理公司代理施工招标。招标代理公司确定该项目采用公开招标方式招标，招标公告在当地政府规定的招标信息网上发布。招标文件中规定：投标担保可采用投标保证金或投标保函方式担保；评标方法采用经评审的最低投标价法；投标有效期为60天。
业主对招标代理公司提出以下要求：为了避免潜在的投标人过多，项目招标公告只在本市日报上发布，且采用邀请招标方式招标。
项目施工招标信息发布以后，共有12家潜在的投标人报名参加投标。业主认为报名参加投标的人数太多，为减少评标工作量，要求招标代理公司仅对报名的潜在投标人的资质条件、业绩进行资格审查。
开标后发现：
(1)A投标人的投标报价为8000万元，为最低投标价，经评审后推荐其为中标候选人。
(2)B投标人在开标后又提交了一份补充说明，提出可以降价5%。
(3)C投标人提交的银行投标保函有效期为70天。
(4)D投标人投标文件的投标函盖有企业及企业法定代表人的印章，但没有加盖项目负责人的印章。
(5)E投标人与其他投标人组成了联合体投标，附有各方资质证书，但没有联合体共同投标协议书。
(6)F投标人的投标报价最高，故F投标人在开标后第二天撤回了其投标文件。
经过标书评审，A投标人被确定为中标候选人。发出中标通知书后，招标人和A投标人进行合同谈判，希望A投标人能再压缩工期、降低费用。经谈判后双方达成一致：不压缩工期，降价3%。
[问题]
分析A～E投标人的投标文件是否有效，说明理由。
