生物圈是地球上所有生物与其生存的环境形成的一个统一整体，包括所有的生态系统，因此是最大的．

A海洋生态系统、B陆地生态系统、D城市生态系都包括在D生物圈中，因此地球上最大的生态系统是D生物圈．

故选：D