答：A：农田生态系统，属于生物圈中的岩石圈，因此不是最大的，故该选项不符合题意；

B：海洋生态系统属于生物圈的水圈，是生物圈的一部分，故该选项不符合题意；

C：草原生态系统是属于生物圈中的岩石圈，只是生物圈的一部分，故该选项不符合题意；

D：生物圈，包括所有的生态系统，因此是最大的，符合题意．

故选D