某市城乡规划区的东南部，按照批准的总体规划方案，有一个约60hm²的城乡规划绿地。
某科研单位与当地村委会签订协议，在规划绿地内(现在为耕地)占用3hm²土地建设住宅，补偿费用1000万元。一年后建成多层住宅五栋，建筑面积2.5hm²，该科研单位在分房的过程中有职工向城乡规划行政主管部门举报该单位领导搞违法建设，要求查处。经查后，城乡规划执法人员认为，该科研单位和村委会对农村集体土地进行变相买卖违法侵占耕地，同时也未报城乡规划行政主管部门审批，没有办理建设用地规划许可证和建设工程规划许可证。即其占地建设属于违法建设，且侵占规划绿地，严重影响城乡规划，违法事实清楚，不用再找当事人调查，于是根据《城乡规划法》对违法建设作出予以没收的行政处罚决定，并经部门领导批准发出了行政处罚决定书。送达后，科研单位不服该行政处罚，向人民法院提起诉讼，经法院审理，判城乡规划行政主管部门败诉。
试分析：败诉的原因是什么城乡规划主管部门应该如何正确处理此案

[背景材料]

某施工单位受建设单位的委托承担了某20层大厦的玻璃幕墙施工任务，并签订了施工合同，合同工期为70天，建设单位要求施工单位开工之前提交施工方案，施工单位组织有关人员编写了施工方案并提交建设单位，在施工前进行了设计、技术交底工作。

在施工过程中，采取了如下的施工方法和措施：

(1)在立柱和支座接触面之间加防腐隔离刚性垫片；

(2)立柱在预装、初步定位和自检合格后，正式焊接牢固；

(3)横梁两端与立柱连接处用铆钉铆接后，嵌入密封胶密封；

(4)打胶时先打横向胶，后打竖向胶；竖向胶缝宜自下而上进行，胶注满后，应检查是否有气泡等；

(5)幕墙钢龙骨架进行二次防腐处理后应进行自检，合格后，进入下一道工序；

(6)幕墙上端封口设置挡水板，防止雨水渗入室内。

[问题]

施工过程中采取的施工方法和措施中的不妥之处有哪些？请指出来，并改正。