参考答案：

菌种退化的原因：保藏方法不妥、保藏操作不当、传代不当、培养基不适、回复突变。

防止菌种退化的措施从菌种选育方法上考虑1）进行充分的后培养及分离纯化2）增加突变位点，减少基因回复突变的几率

从菌种保藏方式上考虑1）尽量减少传代次数2）选择适宜的保藏培养基从菌种培养适宜条件上考虑1）结构类似物抗性菌株在保藏培养基中应添加相应药物及时淘汰回复突变细胞。2）基因工程菌添加抗生素于培养基中防止质粒的丢失。

从菌种管理的措施上考虑：复壮1）定期对保藏菌种分离纯化，淘汰已退化细胞；2）定期对发酵液进行分离筛选