参考答案：C, D

解析：根据《中外合作经营企业法》第10条：中外合作者的一方转让其在合作企业合同中的全部或者部分权利、义务的，必须经他方同意，并报审查批准机关批准。A项合法。根据该法第12条规定，中外合作者的一方担任董事会的董事长、联合管理机构的主任的，由他方担任副董事长、副主任。B项合法。该法第17条第1款：合作企业可以向中国境内的金融机构借款，也可以在中国境外借款。C项不合法。该法第25条规定：中外合作者履行合作企业合同、章程发生争议时，应当通过协商或者调解解决。中外合作者不愿通过协商、调解解决的，或者协商、调解不成的，可以依照合作企业合同中的仲裁条款或者事后达成的书面仲裁协议，提交中国仲裁机构或者其他仲裁机构仲裁。D项不合法。