A、上课的时间是45分钟是从开始上课到下课的这一段时间段．所以是时间．故A错误；

B、上午9点40分开始上早自习，是我们上课的开始时刻．故B正确；

C、从乌鲁木齐开到库尔勒大约需要7个小时．是从发车到汽车到达目的地的时间段，不是时刻．故C错误；

D、从家到学校骑自行车约15分钟，是从出发到人到达目的地的时间段，不是时刻．故D错误．

故选：B