参考答案：D

解析：基因突变是在分子水平的变异，A正确：染色体结构的变异属于染色体水平的变异，可以用光学显微镜观察到，B正确；基因重组只是控制不同性状的基因重新组合，不产生新的基因，C 正确；根据密码子的容错性及发生的位置，基因突变不一定会引起生物性状的改变．染色体结构变异可能会引起生物性状的改变，D错误。