A、因为同种元素的原子和离子最外层电子数不同，所以同种元素的原子与离子的化学性质是不同的，故A正确；

B、离子可以通过得或失电子而变成原子，原子失去或得到电子可以离子，故B正确；

C、原子变成离子时，电子层数不一定发生改变，特别是得电子的时候，电子层数一般不变，故C错误；

D、离子是指带电的原子或原子团，说法正确，故D正确．

故选C．