参考答案：A, B, D

解析：关于涉外刑事诉讼中的国籍确认问题，《刑诉解释》第394条作了明确的规定，根据该条外国人的国籍，根据其入境时的有效证件予以确认；国籍不明的，以公安机关会同外事部门查明的为准。国籍确实无法查明的，以无国籍人对待，适用涉外刑事案件审理程序。根据该规定，国籍确认分为三类情况：第一，以入境时的有效证件为确认标准。A中的犯罪嫌疑甲，入境时持有有效证件，以该有效证件确认甲的国籍就是此种情形。第二，国籍不明的查明标准，以公安机关会同外事部门查明的为准。B就属于这种情况。第三，国籍确实无法查明的，以无国籍人对待。D中的犯罪嫌疑人丁，国籍不明，经公安机关会同外事部门调查确实无法查明，按照无国籍人对待就属于这种情形。因此．A、B、D是正确的。而根据《公安机关规定》第348条，确实无法查明的，可以按照其自报的姓名移送人民检察院审查起诉。这是对外国籍犯罪嫌疑人身份确认进行的规定，而非国籍。因此，C是错误的。