A、根据动能定理得知，子弹克服阻力做功等于子弹动能的减小，根据能量守恒可知，子弹动能的减小等于系统产生的内能和木块获得的动能，故A错误．

B、对于子弹来说只有阻力做功，由动能定理得知，阻力对子弹做的功与子弹动能的减少相等．故B正确．

C、子弹和木块相互作用力大小相等，但二者的位移大小不同，做功不同．所以子弹克服阻力做的功与子弹对木块做的功不等．故C错误．

D、相对于地面而言，子弹的位移大于木块的位移，子弹和木块相互作用力大小相等，根据功的公式W=Fl可知，子弹克服阻力做的功大于子弹对木块做的功．故D正确．

故选BD