A、用GPS定位系统研究汽车位置时，汽车的大小可以忽略，所以能把它看作质点．故A正确．

B、研究“神舟八号”飞船绕地球运转时，飞船的大小和形状对所研究的问题影响可忽略不计，可以将飞船视为质点．故B正确．

C、研究乒乓球运动员张继科发出的乒乓球时，运动员的姿态和动作影响很大，不能把他看作质点．故C错误．

D、研究火车穿越一山洞所需时间时，火车的大小和形状对研究它的运动影响不可忽略，所以火车不可以看作质点．故D错误．

故选AB