A、废水中含有许多不明成分的有毒物质，直接灌溉农田可能污染土壤和农作物，所以不正确．

B、大米霉变生成的黄曲霉素，是剧毒物质，而且性质稳定，只是清洗或蒸煮不能除去，所以发霉的大米不能再食用，所以B不正确．

C、如果是固体药品一般要求放回原瓶，液体药品不允许，因为液体药品变质后放回可能将整瓶药品污染了，所以不对．

D、一水多用，可以节约水资源，所以正确．

故选D