①研究跳水冠军郭晶晶在跳水比赛中的空中姿态时，人的形状不能忽略，所以不能看成质点，所以①错误；

②研究奥运冠军王军霞在万米长跑的过程中，人的形状可以忽略，所以能看成质点，所以②正确；

③研究一列火车通过某路口所用的时间时，火车的长度是不能忽略的，此时火车不能看成质点，所以③错误；

④考察船去南极的途中，船的大小相对于船走的路程来说是很小的，可以忽略，所以④正确．

所以可以看成质点的是②④，所以D正确．

故选D．