参考答案：

难点主要包括：组织定位、资金来源、活动方式等。

第一，明确非政府组织的定位，即配合呼应政府在湖泊保护方面的依法行政行为，同时大力宣传湖泊保护的重要性和具体措施，开展生态环保和形式多样的调研活动，积极向相关部门建言献策，发动社会公众的积极性。

第二，政府相关部分要加大对相关组织的支持力度，简化非政府组织向有关部门申请资金的行政审批环节等，同时，多方拓展资金来源的渠道，鼓励企业和个人捐赠，吸引相关领域基金会等的资助。

第三，丰富活动方式，积极开展环保体验、知识竞赛等活动，激发民众保护湖泊的积极性，组织引导民众从自身做起，从身边的小事做起，使湖泊保护的理念渗透到生活的各个角落。