A、因质子在原子核内，不会发生变化，则同种元素的原子和离子的质子数相同，故A错误；

B、原子中质子数等于电子数，但原子在形成离子时需要得到或失去电子，则质子数不等于电子数，即同种元素的原子和离子的电子数不同，故B正确；

C、因中子在原子核内，则中子数不会变化，则同种元素的原子和离子的中子数相同，故C错误；

D、因质子数等于核电荷数，质子数不变时核电荷数不变，即同种元素的原子和离子的核电荷数相同，故D错误；

故选B．