威胁生物多样性的原因有：滥采乱伐、滥捕乱杀、环境污染、外来物种的入侵．其中，外来物种的入侵往往会威胁当地的原有生物物种的生存．生物入侵是指某种生物从外地自然传入或人为引种后成为野生状态，并对本地生态系统造成一定危害的现象．这些生物被叫做外来物种．外来入侵物种具有生态适应能力强，繁殖能力强，传播能力强等特点．

A、被人带到澳大利亚的英国家兔演变成了与绵羊争夺食物、破坏草原植被的野兔，就会破坏生态平衡，使当地植被受到严重破坏，这在生物学中称为外来物种入侵．故不符合题意．

B、近年来，我国南方某些沿海地区，一种原产南美洲的叫做薇甘菊的“植物杀手”悄悄地登陆了，在气候温暖、雨量充沛的条件下适应能力强，繁殖能力强，传播能力强，又没有天敌故薇甘菊等入侵者大量繁殖数量剧增，茂密的藤蔓缠绕或覆盖当地植物，夺取本应属于当地植物的阳光和养料，使当地植被受到严重破坏，这在生物学中称为外来物种入侵．故不符合题意．

C、地中海蝇原产西非，1842年传入西班牙，以后在地中海沿岸各国迅速蔓延．近一个半世纪以来，此虫已随果蔬等传播到六大洲的80多个国家和地区，成为世界性果蔬大害虫．中国将其公布为进口植物检疫一类危险性害虫，对其检疫极其严格．规定“禁止美国生产的水果、蔬菜（仅限蕃茄、茄子、辣椒等）进口“，“入境检查发现带有水果、蔬莱者，由口岸检验检疫人员没收销毁处理．”这在生物学中称为外来物种入侵．故不符合题意．

D、赤潮是在特定环境条件下产生的，相关因素很多，但其中一个极其重要的因素是海洋污染．大量含有各种含氮有机物的废污水排入海水中，促使海水富营养化，这是赤潮藻类能够大量繁殖的重要物质基础，国内外大量研究表明，海洋浮游藻是引发赤潮的主要生物，在全世界4000多种海洋浮游藻中有260多种能形成赤潮，其中有70多种能产生毒素．他们分泌的毒素有些可直接导致海洋生物大量死亡． 所以使得一部分湖水变臭，鱼虾无法生存．这不是外来物种入侵．故符合题意．

故选：D．