答案：D

题目分析：两者都是对农业的生产关系的调整，都是促进生产力的发展，性质并非相反，因此A错误；后者是在坚持土地公有的前提下，把经营权交给了农民手中，因此并非对合作社性质的社会主义改造的发展，因此B错误；C项错误，实行家庭联产承包责任制，是在坚持土地公有的基础上进行的，并非否定了前者。故选D。

点评：三大改造是对农业、手工业和资本主义工商业的社会主义改造，1956年，改造完成，社会主义经济体制建立。对农业的改造主要是通过实行建立公有制经济，建立合作社的形式进行的。家庭联产承包制是在保障土地公有的前提下，把土地分配给农民使用，调动了农民的生产的积极性。土地的所有权并未发生变化。