参考答案：

业务（1）中，企业的处理不正确：超过职工工资总额5%的部分，即剩下3%的部分不能在企业所得税前扣除。财税[2009]27号规定：企业为全体员工缴纳的补充养老保险和补充医疗保险，分别在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除；超过的部分，不予扣除。

业务（2）中，企业对补充养老保险的处理不正确，对补充养老保险企业负担的部分暂不作为工资、薪金缴纳个税；个人负担的部分，在不超过本人缴费工资计税基数的4%标准内的部分，暂从个人当期的工资、薪金应纳税所得额中扣除。职工取得的企业支付的补充医疗保险应并入职工的当月工资一并缴纳个人所得税，企业对补充医疗保险的处理正确。