A、构成物质的微粒有原子、分子、离子，所以，A正确；

B、原子是由居于原子中心带正电的原子核和核外带负电的电子构成，所以，B正确；

C、原子是化学变化中的最小微粒，原子在化学变化中不能再分，所以，C正确；

D、在原子、分子、离子、电子各微粒中，原子、分子呈中性，离子是带电的原子或原子团，电子带负电，所以，D错误．

故选D．