答案：A

题目分析：含有非极性共价键的化合物不一定是共价化合物，例如过氧化钠中含有非极性键，属于离子化合物，A不正确；全部由共价键形成的化合物是共价化合物，B正确；含有离子键的化合物一定是离子化合物，C正确；同一种非金属元素的原子之间形成的化学键是非极性键，D正确，答案选A。

点评：该题是高考中的常见题型，属于基础性试题的考查。难度不大，主要是考查学生对化学键知识的了解掌握程度。该题的关键是明确化学键和化合物的关系，然后结合题意灵活运用即可，有利于培养学生的逻辑推理能力和灵活应变能力。