ABD

题目分析：含有离子键的化合物是离子化合物，全部由共价键形成的化合物是共价化合物，这说明在离子化合物中可以含有共价键，但在共价化合物中一定不可能含有离子键，AB正确；C不正确，例如氢气等单质分子中；D正确，属于化学变化的实质，答案选ABD。

点评：该题是基础性试题的考查，也是高考中的常见题型和考点，侧重对学生基础知识的巩固和训练，有助于培养学生的逻辑推理能力和抽象思维能力。该题的关键是明确化学键的概念，以及化学键和化合物的关系，然后灵活运用即可。