A、研究地球的自转时，地球有大小和形状不能忽略，不能看作质点，否则就无法分辨地球的转动．故A错误．

B、研究的是自行车车轮自身的旋转情况，转动的物体研究自身转动时，物体自身尺寸不能忽略，所以不可以看作质点，所以B错误．

C、研究火车从南京到上海的运动所需时间时，火车的长度能忽略，可以看成质点，所以C正确．

D、研究火车通过长江大桥所需时间时，火车的长度不能忽略，不能看成质点，所以D错误．

故选C．