因A、B、C、D、E是同一周期的五种主族元素，A和B的最高价氧化物对应的水化物显碱性，且碱性B＞A，

则金属性B＞A，

C、D两种元素对应气态氢化物的稳定性C＞D，则非金属性C＞D，

由同周期元素从左到右，元素的金属性减弱，非金属性增强，

则A、B、C、D的原子序数由小到大的顺序为B＜A＜D＜C，

又E是这五种元素中形成简单离子半径最小的元素，A、B、E均为金属，具有相同的电子排布，

根据离子半径的比较规律：径小序大，则三者中E的原子序数最大，

所以五种元素的原子序数由小到大的顺序为B＜A＜E＜D＜C，

故选D．